Stokkebæk Å er et vandløb på Sydøstfyn, der har sit udspring vest for Gudbjerg i det gamle Gudbjerg Sogn.
Åen gennemløber landskabet og har tidligere givet kraft til en række vandmøller på turen til Sydøstfyns kyst ved , nogle kilometer nord for Lundeborg.
Vandmøllerne var:
- Mullerup
- vestkanten af Gudbjerg Sogn.
- vest for Gudme by.
- , bag Hesselager Kirke.
- i dalen ved mejeriet i , det nu nedlagte
Stokkebækskolen
Stokkebæk gav i august 2011 navn til Stokkebækskolen, som er en sammenlægning af skolerne i Hesselager, Gudme og Gudbjerg. De tre landsbyer, som åen løber igennem.